慶應医学賞(けいおういがくしょう、The Keio Medical Science Prize)は、世界の医学・生命科学の領域において、医学を中心とした諸科学の発展に寄与する顕著、かつ創造的な研究業績をあげた研究者に対して、慶應義塾医学振興基金が与える賞である。
制度の創設から十数年という歴史の浅さにもかかわらず、本賞の受賞者のうち、4名が後にノーベル生理学・医学賞を、2名が後にノーベル化学賞を受賞しており、ノーベル賞の前哨戦としても注目されている。世界的には、ラスカー賞、ガードナー国際賞、ウルフ賞と並び医学領域で最も権威のある賞の一つとして国際賞たる地位を確立しており、むろん国内最高峰の威信を有する。
受賞者には賞状とメダルおよび賞金2000万円が贈られる。授賞式は慶應義塾大学で行われ、受賞者による記念講演会およびシンポジウムが開催される。
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